9月13日 Python生物信息学数据管理
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第一二章笔记：
1，编程大致概括为5点：组织数据、使用其他程序、计算、读取及写入文件。
2，使用math模块必须先import math，一般使用规则是（例如）math.log（），或者直接使用from math import log。
3，python通常一行写一个指令，跨越几行时加上反斜杠‘/，带三引号的字符串可以跨越多行。
4，索引，‘protein'[0]提取第一个字符。
5，切片，‘protein’[0:3]从第一个字符开始，停止于第三个字符后。
6，s.count(a)表示a在s中出现的次数。
7，print()函数使用时，可用逗号分隔多个变量，并打印在一行里。每个print语句后会自动加一个换行符，加一个逗号会抑制换行符。
8，range（10）重复10次，random.randint(0,3)表随机生成0到3之间的数。
自测题2.1
seq = '''MSAKKPVQSKLNIGNPTIPVTSNRSTAPKPVPGQPQFVNQEKKQQSQNTTTGAFRSNQNNANSGGNGNFELDDLHLALKSCNEIGSAKTLFCFFMELQKINDKIPSKKNTELIKNDPQFQYFCHNTILCTEQSYDEKTIEKLAKLEYKLEYKNSYIDMISKVIKELLIENKLNKLQTFGYKLVNNEFGNQNHLGMMQQNQDSSHNSNFMVKCDYINLNKQCMITKNWEKVYFYLGDHLFMHIYKEYMIFLKTRDESLVQISGTNIFCYLNEKLGRLQAAFYEGPNKNAANSAAQGSNPEANDLISAEQRKINTAIVMKKTHKYNIKAADESYLTNQEKGFWDDQIKRNRLFYCAHQNRFFQKHILNSKTLSQQQIRDNIYKEVFGFNRVRAELKGKVMSIIEQVIVNQKKFDFKYYLSKNCPLPENWKNLKKSFLEDAAVSGELRGQVFRQLFEYQQDQRQISNFLTEFVANVFPKNFLEGKNKKIFNKKMLQFVKFNRFESFTKISLLNKFRVNEVSWLSFKCKDENKKFFMNENEHVFFKVLKWVFEDLAITLMRCYFYSTEKAKEYQRIFYYRKNIWNMIMRLSIDDLLKQNLKQVEKKEMRIFCESQNFAPGKLRLIPKGDTFRPIMTFNRKIPNQVGKFQSRMTTNNKLQTAHMMLKNLKSKMFKHSFGFAVFNYDDIMKRYENFVQKWKQINSPKLYFVAMDIEKCYDNVDCERVVNFLQKSDLMDKEYFILNTFVLKRKNNIIVERSNFRKLPIKQYFRYKFQKIGIDGSSYPTLFEILEDEFNDLNMKRTIIVEQEQRKKFPKNDLLQPVLKICQNNYVTFNKKQYKQMKGIPQGLCVSYILSSFYYANLEENALQFLRKESMDPEKPEINLLMRLTDDYLLMTTEKNNAMLFIEKLYQLSL'''
for aa in 'ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY':
number = seq.count(aa)
print(aa,number)2.3
seq = '''MSAKKPVQSKLNIGNPTIPVTSNRSTAPKPVPGQPQFVNQEKKQQSQNTTTGAFRSNQNNANSGGNGNFELDDLHLALKSCNEIGSAKTLFC'''
for i in range(len(seq)):
print(seq[0:i])全部评论 (0)
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