R语言相关性分析
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通过样品之间的相关性分析可以观察组内样品之间的生物学重复。同时组内样品相对组间样品的相关系数越高，获得的差异代谢物越可靠。将皮尔逊相关系数r（Pearson’s Correlation Coefficient）作为生物学重复相关性的评估指标。皮尔逊相关系数利用R软件的内置cor函数计算，|r|越接近1，说明两个重复样品相关性越强
library(corrplot)
a <- mtcars
M = cor(a)
corrplot(abs(M), type = 'lower',
method = 'color',
#order = 'AOE',
diag = FALSE,
tl.pos = 'ld',#字体位置
cl.pos = 'r',#图例位置
tl.col = 'black',#轴字体颜色
cl.length = 5, #数字大小
addCoef.col = 'white',#数字颜色
col.lim = c(0,1),#范围必须覆盖矩阵
col = colorRampPalette(c("#d53e4f",
'#fdb366',
"#6cc4a4",
'#d6de96',
"#d53e4f"))(100),
outline = "white"
)
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