生物信息学之 anconda / miniconda

 wget ftp://gsx.genek.tv/training20200310/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh # 给一个张旭东老师的好用的脚本，下载下来后

    
 bash xxx.sh # 就能安装 miniconda ,一直回车，yes就行了

 conda install xxx 安装软件  
    
 conda search xxx 搜索软件  
    
 conda install -c 源 直接指定源安装软件

 conda info --env # 查看当前 conda 环境

    
 conda env list # 查看当前 conda 环境
    
 conda create -n python27 python=2.7  # 创建一个python 2.7 的环境
    
 conda activate python27  # 进入创建的 python27 环境
    
 conda deactivate #退出python环境

 conda config  # 运行 conda 的 .condarc 配置文件

    
 conda config --show channels # 查看源
    
 conda config --add channels .... # 添加源
    
 可以通过 .condarc 文件修改源  
    
 show_channel_urls: true # 设置搜索时显示通道地址
    
 如果安装的源不生效，可以把 .condarc 文件中的 - defaults 那行去掉（这一行的意思是使用 conda 默认的源）

 conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

    
 conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/ 
    
 conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
    
 conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/menpo/
    
 conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/peterjc123/
    
 conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
    
 conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
    
 conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/
    
 conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/r/
    
 conda config --set show_channel_urls yes
    
 # 北外的一个源，和清华源差不多但是速度很快