（生物信息学）R语言绘图初-中-高级——3-10分文章必备——介绍（初级）

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生信文章图片要求：

Figure里面的图片主要包括位图和矢量图 两种。

位图通常通过显微镜或照相机等设备直接捕获实验图像。其显著特点是放大后会出现模糊现象，并且高像素的图片通常会导致文件体积较大。例如，在细胞免疫荧光成像及电子显微镜成像等领域中常见的实例包括细胞表面蛋白的定位以及微观样本的观察等具体场景。对于处理位图这类图像数据，常用的专业工具包括Photoshop 等专业软件。

矢量图 也被称作向量图形，通常由绘图软件生成，并主要由线条和颜色块构成。其大小一般控制在约100KB，并且无论怎样放大都不会出现变形。

Picture的格式

在上文中提到了SCI论文中Figure的构成要素，请具体说明这些图片需要满足什么样的格式要求？进一步探讨哪些格式特征能够满足目标期刊的具体要求。

众所周知，在图像处理领域中存在多种常见的文件格式包括JPEG、 JPG 等等这些不同类型的图像文件各有其独特的应用场景优势与局限性因此在选择合适的图像文件类型时通常会根据具体的工作需求来做出相应的选择

然而，在发表SCI文章时尤其在生物医学领域中大多数期刊都要求最终的Figure必须采用Tiff格式有些期刊则接受JPG与Tiff双格式

因此，最保险的做法就是把Figure存储为Tiff格式。

在其中的Figure中，图像可存储为JEPG或Tiff格式；而对于矢量图形则通常以Tiff格式保存。

最终导出整张Figure时，最优选择的方式就是以Tiff格式保存图像数据。

Picture的分辨率及大小

我们遵循如下分辨率要求：通常需要设定不低于 $...$ 的标准（此处假设存在数学公式）。在使用Illustrator或Photoshop进行图像导出时，请将其分辨率设置为 $...$ DPI（此处假设存在数学公式）。这些标准普遍认可并能满足大多数杂志的需求。

图片尺寸 ，大多数SCI期刊通常建议将Figure的大小控制在10MB以内。
如果图片过大，在投稿时可能会导致速度变慢。
超过10MB后，则需要对图像进行压缩处理。
不论是使用Tiff格式、位图还是线图等文件类型，
都可以采用LZW无损压缩技术来实现文件体积的减小。

在图片处理过程中， Photoshop 软件是进行图片压缩时最常用的选择。打开图像文件后，在菜单栏中找到并点击 "图像压缩" 选项，在该设置中选择 LZW 压缩算法即可完成压缩操作。

Picture的色彩格式

图片的格式一般有RGB和CMYK两种。

大多数SCI期刊均采用RGB色彩模式的插图文件作为标准，在极少数情况下需要作者提前将CMYK色彩模式的插图文件提交给出版机构以确保印刷质量。关于色彩模式转换的具体操作，请参考使用PS等位图编辑软件完成相关设置。

同时，在视觉设计中通常建议尽量避免使用红色和绿色两种色调。由于色盲人群无法区分这两种颜色的区别性特征，在图表标识时最好选择不相邻的颜色色调，并且应尽量避免使用纯灰色作为背景或对比色。然而，在生物医学领域的图表设计中对这两种颜色的要求有所放宽，在常见的荧光显色技术和生信分析图表中仍然可以看到大量采用红绿色的情况。

Figure的字体

在SCI文章中，通常建议将Figure的字体选用英语世界常用的Arial或Times New Roman字体。如果决定使用Times New Roman，则要求所有图表必须统一使用Arial格式；反之，则要求所有图表必须统一转换为Times New Roman字体。

在设计文档时，默认情况下文字大小应控制在 $7$ 至 $12$ 字号之间。为了确保阅读体验，请避免选用小于 $6$ 字号或大于 $14$ 字号的文字格式设置。通常情况下，默认状态下采用 $7$ 字号能够使图表更加美观清晰。

Figure中的线形图或柱形图的线条粗细

在SCI论文中，图形（如线型图或柱状图）通常要求其线宽控制在 $[...]$ 毫米范围内。整体应当保持一致风格。例如可以选择 $[...]$ 毫米作为标准。建议所有图表遵循这一规范。此外需要注意的是，在视觉效果上更倾向于使用黑色来增强可读性，并特别强调坐标轴应...

R语言绘图的优势：

无需为此类服务支付任何授权费用；对于个人和企业而言，在成本方面具有一定的吸引力。

开源项目中采用open source策略能够有效提升项目的可访问性。在代码开发过程中, 采用代码的开放性提供了完整的细节信息, 这对开发者以及企业级的应用具有重要意义。

在统计学、计量学、数据分析与可视化相关的领域中具有较高的普及程度。这一现象在国际市场中更加显著地体现出来；这不仅使R成为这一类领域中的主要工具之一，并且能够有效地描述问题并促进信息之间的交流。

该语言具备高度的灵活性。
作为支持元编程与函数式编程的动态类型语言,R语言在设计上同样表现出色。
对元编程与函数式编程的支持也非常完善。
这使得该语言在灵活性方面表现出色。
开发者能够执行常规计算和非标准计算任务。
从而进一步提升了该语言的可操作性和灵活性水平。